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熒光定量數(shù)據(jù)分析準(zhǔn)則,請(qǐng)參考以下幾點(diǎn)

更新時(shí)間:2020-08-25      瀏覽次數(shù):1798

熒光定量數(shù)據(jù)分析準(zhǔn)則,請(qǐng)參考以下幾點(diǎn)

 

熒光定量是通過(guò)熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性的探針,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,實(shí)時(shí)在線(xiàn)監(jiān)控反應(yīng)過(guò)程,結(jié)合相應(yīng)的軟件可以對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析,計(jì)算待測(cè)樣品模板的初始濃度。

 

 熒光定量PCR技術(shù)是通過(guò)熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性探針,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,實(shí)時(shí)監(jiān)控反應(yīng)過(guò)程。隨著PCR 反應(yīng)的進(jìn)行,反應(yīng)產(chǎn)物不斷累積,熒光信號(hào)強(qiáng)度也等比例增加。每經(jīng)過(guò)一個(gè)循環(huán),收集一次熒光強(qiáng)度信號(hào),這樣就可以通過(guò)熒光強(qiáng)度變化監(jiān)測(cè)產(chǎn)物量的變化,結(jié)合相應(yīng)的軟件對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析,可以得到熒光擴(kuò)增曲線(xiàn),計(jì)算待測(cè)樣品初始模版的量。實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是一次由定性技術(shù)向熒光定量定量技術(shù)的飛躍,運(yùn)用該項(xiàng)技術(shù),可以對(duì)DNA、RNA樣品進(jìn)行相對(duì)定量、定量和定性分析。 

 

判斷數(shù)據(jù)的有效性,可以結(jié)合擴(kuò)增曲線(xiàn),溶解曲線(xiàn),標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)以及NTC(檢驗(yàn)引物)和NRC(檢驗(yàn)?zāi)0澹﹣?lái)分析。

1.擴(kuò)增曲線(xiàn)應(yīng)呈現(xiàn)出平滑的S型曲線(xiàn),起始無(wú)擴(kuò)增,起峰時(shí)間正常,由擴(kuò)增曲線(xiàn)得到的Ct值是判斷實(shí)驗(yàn)成功與否的重要參考,Ct值有一定的可信范圍,臨床檢驗(yàn)小于33,科學(xué)研究小于38,內(nèi)參基因一般小于20,且樣品間內(nèi)參的Ct值差不超過(guò)1,表明內(nèi)參基因表達(dá)量穩(wěn)定,復(fù)孔Ct值標(biāo)準(zhǔn)偏差不超過(guò)0.5;

2.溶解曲線(xiàn)應(yīng)呈現(xiàn)單峰,峰的寬度較小,NTC和NRC無(wú)特異的峰出現(xiàn);

3.標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的斜率范圍-3.58~-3.10,對(duì)應(yīng)引物的擴(kuò)增效率范圍90%~110%,R2代表線(xiàn)性擬合度,一般大于0.95;

4.NTC用于判斷反應(yīng)是否存在模板污染,引物是否特異,是否會(huì)形成引物二聚體。NTC狀況是沒(méi)有擴(kuò)增,即擴(kuò)增曲線(xiàn)和溶5.解曲線(xiàn)與基線(xiàn)重合,沒(méi)有Ct值。NTC有擴(kuò)增的情況下,至少與加入模板體系的Ct值相差5或10以上;

6.NRC用于判斷cDNA模板中是否存在基因組DNA殘留,可以間接反映RNA中基因組DNA污染情況,理想情況下,NRC沒(méi)有Ct值,有Ct值的話(huà)至少要跟加入cDNA模板體系的Ct值相差5或10以上。

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