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上海信帆生物:新機制能夠使RNA結合蛋白誘導遠程剪接調控

更新時間:2016-06-09      瀏覽次數:1406

發現一種機制,它能夠使指導前體mRNA剪接的RNA結合蛋白誘導一種難以想象遠距離調控效應。這一研究發現將有望于研發糾正導致很多疾病的不恰當剪接的靶向治療方法。
研究小組一直在試圖理解指導細胞功能的zui基本的信號。根據Lovci所稱,這項工作拓寬了對未來的研究必須考慮的課題的視野。更重要的是,這項工作擴大了設計憑借稱為“反義rna寡核苷酸(ASOs)”的遺傳物質對分子缺陷進行糾正的合理療法的潛在目標范圍。
基因組其余序列的作用,在很大程度上還是一個謎,因此它們被稱為“垃圾DNA”。自從其它非人類基因組被測序以來,科學家們已經能夠描繪基因組上那些經過數以百萬年進化后顯著保守的序列。人們普遍認為,進化限制的這個證據表明,即使基因組的某些片段沒有編碼蛋白,其對于生命和發育還是極其重要的。

采用這個進化保守性作為一個基準,科學家們描述了細胞利用這些非蛋白編碼區域的不同方式。例如,一些區域作為DNA與蛋白對接的位點,能夠激活或者抑制rna的轉錄。其它的區域,也是這項工作的研究重點,能夠調控可變mRNA剪接。

真核細胞采用可變前體mRNA剪接,產生在發育和應對環境過程中的蛋白多樣性。通過有選擇的包括或排除前體mRNA區域,細胞通常獲得基因組中超過20000個基因中的每一個的十個版本。RNA結合蛋白是與這些決定緊密的蛋白類群,但是我們很少知道,它們在細胞中真正起了什么作用。

Lovci說,“對大部分基因來說,蛋白編碼空間在片段上的分布,就像海洋中的島嶼分布模式一樣。RNA加工裝置,包括RNA結合蛋白,必須挑選出這些小的序列部分,將它們地拼接在一起,來制造功能蛋白。我們的研究表明,不僅鄰近這些‘島嶼’的序列空間對基因調控而言非常重要,而且距離這些‘島嶼’ 很遠的進化保守序列對調整剪接決定也很重要。”

因為上述成果挑戰了現有的可變剪接調控的模型,所以調控開始于非常靠近蛋白編碼片段的區域,作者力圖定義一個機制,通過這個機制,遠程的剪接調控也能發生。他們鑒定了存在于調控位點和較遠的蛋白編碼“島嶼” 之間的RNA結構——RNA本身折疊和堿基配對。這種相互作用被稱為“RNA橋”,因為它們能夠把較遠的調控者和它們的目標連接起來。該論文的作者指出,這可能是一種常見的但是未被重視的可變剪接調控機制。

這些研究成果對于生物醫學研究具有可預見的啟示,因為他們所關注的兩種RNA結合蛋白——RBFOX1和RBFOX2,表現出與神經發育失常例如自閉癥和某些癌癥有很強的關系。既然這兩種蛋白起了上游一連串的效應,那么對這些蛋白如何指導可變剪接決定,在糾正導致很多疾病的不恰當剪接決定的靶向治療中,能夠起更大的推動作用。

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